Potrivit lui Ibm Battūta care a vizitat Bagdadul in 1327, în clădirea al-Mustansirīyei se aflau, pe lângă săli de curs, bai, bucătării
, un spital si o bibliotecă. Unul dintre puținele monumente păstrate din perioada abbasida, al-Mustansirīyei ă fost renovată în 1961. Bagdadul ramane un important centru cultural și comercial pana in 1258, cand este cucerit de mongolii condusi de Hulagu. Orașul este distrus si populatia masacrata. Invazia mongola pune capăt Califatului abbasid. În anul 1401, Bagdadul este cucerit de Timur Lenk.
În perioada dintre invazia lui Timur Lenk si cucerirea definitivă de către otomani (1638), Bagdadul ajunge "capitala somnolentă" ă unei regiuni nesemnificative.
