Bacteriile pot fi utile sau daunatoare. Din categoria celor utile as aminti bacteriile lactice, bacteriile acetice si bacteriile fixatoare de azot din aerul atmosferic. Bacteriile lactice au rol in industria laptelui fiind utilizate la obtinerea produselor lactate (iaurt, sana) si a branzeturilor, in industria produselor de panificatie si la conservarea legumelor prin murare. Bacteriile acetice sunt utilizate la obtinerea acidului acetic (otet)
Un alt rol pozitiv: daca nu ar exista bacteriile saprofite, atunci materia organica dar si cea anorganica s-ar acumula in mod continuu in si deasupra solului ducand la poluare.
Bacteriile daunatoare produc boli la plante si la oameni cauzand asa numitele bacterioze. Cele mai periculoase bacterii pentru om sunt cele care produc toxine care afecteaza sistemul nervos central putand duce si la deces (ex Clostridium botulinum este o bacterie ce produce botulism la oameni). La plante bacteriile produc pagube distrugand productia sau organele plantelor.
Bacteriile care produc boli la om si animale pot fi distruse de antibiotice.
