Bacteriile joacă un rol important în procesul de digestie al omului şi al altor animale. Multe bacterii se găsesc în intenstinul omului, iar acestea au rolul de a descompune alimentele şi a produce anumite vitamine de care corpul uman se foloseşte. Unele bacterii trăiesc în pământ şi transformă nitrogenul în substanţe ce ajută plantele. Apoi, oamenii consumă acele plante sub formă de alimente.
Bacteriile sunt responsabile pentru procesul de fermentare prin care sunt produse brânza şi oţetul. Acelaşi proces de fermentare este folosit şi realizarea de substante
